Berada di Kawasan Strategis Kota Baubau
Rumah Sakit Umum Daerah Kota Baubau terletak di Kecamatan Murhum bagian utara antara 5°47' - 5°48' Lintang Selatan dan 122°59' - 122°60' Bujur Timur. Beralamat di Jalan Drs. H. La Ode Manarfa No.20, Kelurahan Baadia, rumah sakit berdiri di atas lahan seluas 6.000 m² dengan luas bangunan 2.071,10 m².
Lokasi RSUD yang dikelilingi pusat pertumbuhan ekonomi, sosial, dan budaya menjadikannya sangat potensial untuk terus berkembang sebagai rumah sakit rujukan kawasan kepulauan Sulawesi Tenggara.